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一种新型猪细小病毒的鉴定和基因组特征分析

时间:2023-10-07   访问量:1021

猪细小病毒(PPVs)是一类小型非包膜病毒,目前已发现7种基因型(PPV1-7)。本研究通过高通量测序(HTS)技术,从广东省猪繁殖与呼吸综合征病毒阳性样本中初步鉴定出一种新型PPV,暂命名为PPV8。PPV8-GDJM2021的近全长基因组长度为4380bp,有两个重叠的开放阅读框(ORF),分别编码NS1和VP1。测序结果表明:PPV8在基因组水平上与PPV1-7的同源性为16.23%-44.18%,与PPV1的同源性相对最高;PPV8-GDJM2021与PPV1和猪bufavirus(PBuV)NS1蛋白序列同源性为31.86-32.68%,与原细小病毒属成员相邻,形成一个独立的分支。在1990—2021年收集的211份临床样本中,有37份样本(17.5%)检出PPV8,这些样本分布于我国12个地区,时间跨度长达24年(1998—2021年)。


原文链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36204286/












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